Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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CTF1Q16619 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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