Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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