Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMPD4Q14CM0 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms