Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERVS71-1P61550 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms