Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms