Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANGAP1P46060 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms