Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms