Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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