Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GCAP28676 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
GCAP28676 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
GCAP28676 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
GCAP28676 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms