Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF3P18847 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF3P18847 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF3P18847 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF3P18847 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF3P18847 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF3P18847 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF3P18847 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF3P18847 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms