Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP2A2P16615 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms