Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF853P0CG23 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms