Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C4BP0C0L5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4BP0C0L5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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