Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms