Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms