Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC6Q9UBN7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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HDAC6Q9UBN7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HDAC6Q9UBN7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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