Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FANCFQ9NPI8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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