Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TMEM27Q9HBJ8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TMEM27Q9HBJ8 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TMEM27Q9HBJ8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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