Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CELF4Q9BZC1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms