Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GABARAPL3Q9BY60 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms