Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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HDAC11Q96DB2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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