Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms