Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC12Q8WUD4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms