Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC9Q8NEP7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms