Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P3H3Q8IVL6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P3H3Q8IVL6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms