Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms