Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
COX19Q49B96 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ACTN2-201ENST00000366578 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
COX19Q49B96 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms