Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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