Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC142Q17RM4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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