Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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PDCD1Q15116 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PDCD1Q15116 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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