Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTN2Q02246 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms