Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FAM3AP98173 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms