Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CBX1P83916 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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