Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms