Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A1P19634 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms