Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DEFA4P12838 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DEFA4P12838 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DEFA4P12838 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DEFA4P12838 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DEFA4P12838 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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DEFA4P12838 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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DEFA4P12838 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DEFA4P12838 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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