Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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CLTBP09497 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLTBP09497 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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