Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TYMSP04818 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TYMSP04818 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TYMSP04818 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms