Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms