Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RNF7Q9UBF6 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms