Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTN3Q9P232 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms