Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL20A1Q9P218 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COL20A1Q9P218 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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COL20A1Q9P218 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms