Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PLVAPQ9BX97 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms