Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PDLIM3Q53GG5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PDLIM3Q53GG5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PDLIM3Q53GG5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PDLIM3Q53GG5 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PDLIM3Q53GG5 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PDLIM3Q53GG5 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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