Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI73

KRTAP19-4, Keratin-associated protein 19-4, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-4Q3LI73 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PYHIN1-205ENST00000392254 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 HIVEP1-205ENST00000484210 1602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ARHGAP25-209ENST00000479844 1933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 LDLRAD1-202ENST00000371362 654 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 NCR2-203ENST00000373089 942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 OR13C5-201ENST00000374779 957 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
KRTAP19-4Q3LI73 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms