Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SIX1Q15475 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SIX1Q15475 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SIX1Q15475 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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