Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PTPRJQ12913 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PTPRJQ12913 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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