Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCC8Q09428 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms