Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
USP46P62068 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP46P62068 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
USP46P62068 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms