Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK8P49336 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms